Nucleul colecțiilor este reprezentat de fondul moștenit de la Muzeul Național de Antichități, constituit în secolul al XIX-lea și în prima jumătate a secolului al XX-lea. Acestuia i s-au adăugat achiziții și donații și mai ales piese recoltate prin săpături arheologice, printre eșantioanele mai importante numărându-se cele de la Histria, Dinogetia, Noviodunum, Tropaeum Traiani, Sucidava și Suceava. Sunt bine reprezentate monedele antice grecești, geto-dacice, romane republicane și imperiale, bizantine, otomane și medievale central-europene. Există și o colecție semnificativă de medalii europene și nord-americane, ponduri și piese asociate monedelor din tezaure (recipiente și podoabe).